Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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HOXC10Q9NYD6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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HOXC10Q9NYD6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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HOXC10Q9NYD6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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HOXC10Q9NYD6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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