Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3AQ96ST3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms