Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms