Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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