Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms