Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms