Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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