Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HJURPQ8NCD3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms