Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT2Q8N9I0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms