Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMC1Q7Z7K0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms