Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6P435 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q6P435 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
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