Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms