Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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