Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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