Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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