Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms