Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP1-1Q07627 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms