Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms