Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms