Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUCB1Q02818 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms