Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms