Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLTCQ00610 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms