Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms