Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVS71-1P61550 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms