Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELLP55199 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELLP55199 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELLP55199 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms