Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms