Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMPOP42166 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPOP42166 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMPOP42166 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMPOP42166 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPOP42166 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMPOP42166 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPOP42166 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPOP42166 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPOP42166 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms