Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPS1P31327 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms