Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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