Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV3-11P04433 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-11P04433 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms