Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCNDBP1O95273 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCNDBP1O95273 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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