Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC27A6Q9Y2P4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC27A6Q9Y2P4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms