Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUX4Q9UBX2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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