Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms