Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms