Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYT17Q9BSW7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms