Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms