Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms