Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECW1Q76N89 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms