Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF7Q6Q0C0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms