Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPGRIP1LQ68CZ1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms