Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms