Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB6CQ53S08 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB6CQ53S08 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB6CQ53S08 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB6CQ53S08 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB6CQ53S08 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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