Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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