Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms