Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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