Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF1AQ15573 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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