Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC10A1Q14973 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms