Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms