Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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